1. Typowanie bakteriofagowe gronkowców złocistych i ocena potencjalnej przydatności bakteriofagów w terapii zakażeń
2. Badanie metodami cytometrii przepływowej i technikami biologii molekularnej wirulencji i podatności na fagocytozę bakterii
3. Badanie mechanizmów lekooporności gronkowców i enterokoków
4. Analiza wpływu wybranych czynników na właściwości metaboliczne gatunków należących do mikrobioty człowieka
5. Badanie struktury i właściwości biofilmu bakteryjnego
6. Identyfikacja serologiczna i prowadzenie muzeum szczepów Salmonella